堆肥腐熟度指标划分为三类：物理学指标、化学指标和生物学指标。堆肥腐熟度的评价方法分为表观分析法、化学分析法、波谱分析法及植物生长分析法4类，与前者的分类方法也比较相似。

　　用有机肥发酵设备发酵有机肥腐熟的标准如下：

　　1、松散度 生物发酵法从发酵的第四天开始松散，呈碎末状。

　　2、气味 生物发酵法从第2天开始臭味减少，第4天基本消失，第5天全没有，第7天散发泥土的清香。

　　3、温度 生物发酵法第2天达到高温阶段，到7天开始回落。保持较长时间的高温阶段，发酵腐熟好。

　　4、PH值 生物发酵法PH值达到6.5。

　　5、含水率 发酵原料初始含水率55%，生物发酵法含水率可降到30%。

　　6、铵态氮（NH4+-N）发酵开始时，铵态氮的含量较快增加，在第4天时达到高量，这是因为氨化作用以及有机氮的矿化作用引起的，随后堆肥中的铵态氮由于挥发损失及转化成为硝态氮而逐渐减少。当铵态氮小于400mg/kg达到腐熟标志。生物发酵法铵态氮含量可降到215mg/kg左右。

　　7、碳氮比 堆肥碳氮C/N比达到20以下，就达到腐熟指标。

　　8、大肠杆菌数和蛔虫卵死亡率。

　　粪大肠菌群数≤100个/克（mL）

　　蛔虫卵死亡率≥95%

　　9、种子发芽率 生物法发酵法发酵的牛、羊粪发芽率达到80%及以上。

　　堆料中微生物的活性变化及堆肥对植物生长的影响常用于评价堆肥腐熟度。这些指标主要有呼吸作用、生物活性及种子发芽率实验等。有机肥发酵设备发酵有机肥腐熟的标准就是这些了。