自然堆肥需要很长时间，而且臭气无法控制；沼气设施可以在处理粪便的同时产生能量。虽然鸡粪处理的方法工艺已比较成熟，但是控制点比较多。例如，保持35度是沼气发酵的良好温度，沼气液的pH值应保持在6.5-7.5之间，沼气池应保持厌氧。对于农民来说，很难把握。

    目前，用鸡粪发酵设备已成为鸡粪处理的主流方式。一般方法是在鲜鸡粪中添加碎秸秆平衡水分，添加适合鸡粪发酵的复合菌，以加速其发酵过程。通常采用槽式堆垛，耙体有规律地转动。该方法可大大缩短鸡粪分解时间，夏季为15天，冬季为21天。这样鸡粪处理后，鸡粪可作为主要有机肥出售。该发酵方法能除去鸡粪臭味，杀灭微生物和虫卵。

    鸡粪处理后的肥料可以施用于农田，同时大大减少了对周围环境的污染。该处理工艺简单易学，比较适合在中小型农场推广应用。

    此外，鸡粪处理设备的工艺目前已比较成熟。添加了水力搅拌和送氧工艺，使发酵周期从15-21天缩短到7天左右，实现了机械化控制和节能，是一个值得推广的鸡粪处理方法。